Пистолетът CZ-100 е създаден в съответствие с най-последните изисквания при изработването на пистолети - той има полимерна рама, УСМ само с двойно действие (DAO) и няма неавтоматични предпазители. Автоматиката на пистолета работи на принципа на отката при къс ход на цевта, заключването е по модифицирана Браунингова схема, чрез прозореца за изхвърляне на гилзата, а отключването на цевта и затвора става чрез снижение на задната част на цевта.

Удароустойчивата полимерна рама, намаляваща видимо теглото на оръжието, има вградени в нея, на отговорни за конструкцията й места, метални елементи за повишаване на издържливостта на детайлите, подложени на натоварване. Дори и при двуредното разположение на патроните в пълнителя, дебелината на ръкохватката е само 32 мм. Пистолетът има автоматичен предпазител, блокиращ ударника докато спусъка не бъде натиснат докрай.

В горната част на затворния блок, зад прозореца за изхвърляне на гилзите, е разположен специален упор (кука), с помощта на който пистолетът може да се зареди само с една ръка, както е хванат за ръкохватката. За целта трябва се натисне върху стабилен премет със здрав ръб. На задната стена на затворния блок има отвор, от който се подава опашката на ударната игла при наличие на патрон в патронника. На предната долна част на рамата има канали за монтиране на лазерен целеуказател или тактическо фенерче. Мерните прибори са фиксирани.

Модела CZ-100 има пълнител с двуредно разположение на патроните, а CZ-101 има едноредно разположени патрони.